Вариантов развития ситуации много... Если система ругается на этот файл, значит у вас проблемы с реестром (т.к. файл System - ветвь реестра)
Для начала снимаем образ с текущего состояния системы и кладем его куда-нить подальше (например на внешний HDD), т.к. в процессе восстановления возможны критические проблемы и будет с чего восстановить данные (как снять образ тут:
http://pchelpforum.ru/b34516/e383/)
0. Грузимся при помощи LiveCD и проверяем ваш системный раздел (диск С, скорее всего) на файловые ошибки (Мой компьютер - ПКМ на диск С - Свойства - Сервис - Выполнить проверку - ставим галку на Автоматическое исправление ошибок - Ок)
1. Можно попробовать восстановить при помощи меню (там где Безопасный режим). Выбираем загрузит последнюю удачную конфигурацию. Чтобы попасть в это меню в процессе включения компа жмем часто и кратковременно F8
2. Можно загрузиться с ERD для Windows XP и сделать восстановление системы из точки отката на дату, предшествующую появлению проблемы (ERD - аглицкий!)
3. Можно вручную попробовать восстановить этот файл. Я писал о такой процедуре здесь:
http://pchelpforum.ru/f34/t60355/2/#post512869